A IDPB tem a sua origem no ano de 1957, simultaneamente na região Norte em Borba/AM e Sudeste em Bragança Paulista/SP, com a vinda de missionários americanos da Pentecostal Church of God, denominação que é fruto do movimento pentecostal da Rua Azuza e que teve sua fundação em 1919.
Os missionários que vieram ao Brasil inicialmente foram o Pr. John Willian King e Robert Fundenburg juntamente com suas famílias. Mais tarde outros missionários vieram cooperar com a expansão da IDPB.
O Primeiro pastor brasileiro da IDPB é o Pr. Raimundo Carneiro Pessoa que foi quem iniciou o trabalho em Borba e no Rio Madeira.
Para prosseguir em seu processo de expansão a IDPB precisa treinar seus obreiros que em sua maioria eram homens simples e de poucas letras. Assim surgiu a Escola Bíblica Central do Brasil com a primeira turma em 1964-1965. A EBCB teve papel preponderante na IDPB até a década de 80, quando se iniciou o processo de regionalização do ensino teológico da IDPB, principalmente no Amazonas, com a SEBAETE e o IBIPAM, ambos iniciativa do Pr. Neri Campos.
A EBCB também foi essencial na expansão da IDPB em Minas Gerais, muito embora as primeiras igrejas mineiras tenham surgido antes da primeira turma da EBCB, foi a partir da presença dos alunos que apoiavam os novos trabalhos que o crescimento dessas igrejas teve impulso.
Podemos afirmar que a Educação Teológica foi e continua sendo fundamental para a expansão da IDPB.